卵巢囊肿一般来讲是可以做试管婴儿的，但是需要经过相关检查以及医生建议才能确定最终结果，不可盲目选择。但是针对病理性卵巢囊肿患者一般是不建议做试管婴儿的，因为病理性卵巢囊肿患者成功率相对较低，即使是胚胎移植成功，胎儿也很难正常生长发育。